Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
ZFHX3Q15911 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
ZFHX3Q15911 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
ZFHX3Q15911 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
ZFHX3Q15911 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC-1.63□□□□□ -2.67
ZFHX3Q15911 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
ZFHX3Q15911 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
ZFHX3Q15911 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
ZFHX3Q15911 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC-1.63□□□□□ -2.67
ZFHX3Q15911 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
ZFHX3Q15911 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
ZFHX3Q15911 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC-1.63□□□□□ -2.67
ZFHX3Q15911 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
ZFHX3Q15911 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
ZFHX3Q15911 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC-1.63□□□□□ -2.67
ZFHX3Q15911 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
ZFHX3Q15911 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
ZFHX3Q15911 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
ZFHX3Q15911 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
ZFHX3Q15911 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
ZFHX3Q15911 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
ZFHX3Q15911 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
ZFHX3Q15911 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
ZFHX3Q15911 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
ZFHX3Q15911 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC-1.64□□□□□ -2.67
ZFHX3Q15911 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
ZFHX3Q15911 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
ZFHX3Q15911 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
ZFHX3Q15911 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
ZFHX3Q15911 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
ZFHX3Q15911 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
ZFHX3Q15911 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-1.65□□□□□ -2.67
ZFHX3Q15911 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ZFHX3Q15911 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ZFHX3Q15911 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ZFHX3Q15911 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ZFHX3Q15911 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ZFHX3Q15911 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ZFHX3Q15911 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ZFHX3Q15911 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ZFHX3Q15911 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ZFHX3Q15911 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ZFHX3Q15911 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ZFHX3Q15911 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ZFHX3Q15911 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
ZFHX3Q15911 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
ZFHX3Q15911 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
ZFHX3Q15911 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
ZFHX3Q15911 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
ZFHX3Q15911 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
ZFHX3Q15911 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
ZFHX3Q15911 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-1.67□□□□□ -2.68
ZFHX3Q15911 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
ZFHX3Q15911 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
ZFHX3Q15911 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
ZFHX3Q15911 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
ZFHX3Q15911 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
ZFHX3Q15911 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
ZFHX3Q15911 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC-1.67□□□□□ -2.68
ZFHX3Q15911 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
ZFHX3Q15911 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
ZFHX3Q15911 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
ZFHX3Q15911 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC-1.67□□□□□ -2.68
ZFHX3Q15911 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
ZFHX3Q15911 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
ZFHX3Q15911 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
ZFHX3Q15911 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
ZFHX3Q15911 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
ZFHX3Q15911 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
ZFHX3Q15911 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
ZFHX3Q15911 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
ZFHX3Q15911 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
ZFHX3Q15911 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
ZFHX3Q15911 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
ZFHX3Q15911 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
ZFHX3Q15911 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
ZFHX3Q15911 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
ZFHX3Q15911 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
ZFHX3Q15911 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
ZFHX3Q15911 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
ZFHX3Q15911 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
ZFHX3Q15911 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
ZFHX3Q15911 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC-1.69□□□□□ -2.68
ZFHX3Q15911 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
ZFHX3Q15911 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
ZFHX3Q15911 Y_RNA.266-201ENST00000364678 96 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
ZFHX3Q15911 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
ZFHX3Q15911 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
ZFHX3Q15911 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
ZFHX3Q15911 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
ZFHX3Q15911 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
ZFHX3Q15911 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC-1.69□□□□□ -2.68
ZFHX3Q15911 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
ZFHX3Q15911 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
ZFHX3Q15911 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
ZFHX3Q15911 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
ZFHX3Q15911 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
ZFHX3Q15911 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
ZFHX3Q15911 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
ZFHX3Q15911 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
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