Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
ATP6AP1Q15904 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ATP6AP1Q15904 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ATP6AP1Q15904 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ATP6AP1Q15904 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ATP6AP1Q15904 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ATP6AP1Q15904 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ATP6AP1Q15904 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ATP6AP1Q15904 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ATP6AP1Q15904 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ATP6AP1Q15904 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.15□□□□□ -2.39
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ATP6AP1Q15904 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ATP6AP1Q15904 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ATP6AP1Q15904 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ATP6AP1Q15904 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ATP6AP1Q15904 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ATP6AP1Q15904 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ATP6AP1Q15904 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ATP6AP1Q15904 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ATP6AP1Q15904 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ATP6AP1Q15904 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ATP6AP1Q15904 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ATP6AP1Q15904 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ATP6AP1Q15904 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ATP6AP1Q15904 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ATP6AP1Q15904 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ATP6AP1Q15904 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ATP6AP1Q15904 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.12□□□□□ -2.39
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ATP6AP1Q15904 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ATP6AP1Q15904 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ATP6AP1Q15904 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ATP6AP1Q15904 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ATP6AP1Q15904 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ATP6AP1Q15904 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ATP6AP1Q15904 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ATP6AP1Q15904 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ATP6AP1Q15904 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ATP6AP1Q15904 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ATP6AP1Q15904 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ATP6AP1Q15904 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ATP6AP1Q15904 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ATP6AP1Q15904 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ATP6AP1Q15904 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ATP6AP1Q15904 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ATP6AP1Q15904 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ATP6AP1Q15904 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ATP6AP1Q15904 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ATP6AP1Q15904 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ATP6AP1Q15904 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ATP6AP1Q15904 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ATP6AP1Q15904 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ATP6AP1Q15904 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ATP6AP1Q15904 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ATP6AP1Q15904 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ATP6AP1Q15904 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ATP6AP1Q15904 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ATP6AP1Q15904 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ATP6AP1Q15904 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ATP6AP1Q15904 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ATP6AP1Q15904 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ATP6AP1Q15904 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ATP6AP1Q15904 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ATP6AP1Q15904 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ATP6AP1Q15904 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ATP6AP1Q15904 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ATP6AP1Q15904 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ATP6AP1Q15904 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ATP6AP1Q15904 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ATP6AP1Q15904 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ATP6AP1Q15904 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.08□□□□□ -2.4
ATP6AP1Q15904 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ATP6AP1Q15904 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ATP6AP1Q15904 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ATP6AP1Q15904 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ATP6AP1Q15904 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ATP6AP1Q15904 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ATP6AP1Q15904 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
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