Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
ALX1Q15699 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
ALX1Q15699 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
ALX1Q15699 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
ALX1Q15699 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
ALX1Q15699 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
ALX1Q15699 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
ALX1Q15699 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
ALX1Q15699 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC-1.78□□□□□ -2.69
ALX1Q15699 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
ALX1Q15699 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC-1.82□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
ALX1Q15699 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
ALX1Q15699 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
ALX1Q15699 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
ALX1Q15699 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
ALX1Q15699 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
ALX1Q15699 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
ALX1Q15699 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
ALX1Q15699 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
ALX1Q15699 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
ALX1Q15699 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
ALX1Q15699 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
ALX1Q15699 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
ALX1Q15699 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
ALX1Q15699 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
ALX1Q15699 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
ALX1Q15699 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
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