Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HERC3Q15034 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HERC3Q15034 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HERC3Q15034 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HERC3Q15034 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HERC3Q15034 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HERC3Q15034 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HERC3Q15034 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HERC3Q15034 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HERC3Q15034 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HERC3Q15034 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HERC3Q15034 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HERC3Q15034 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HERC3Q15034 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HERC3Q15034 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
HERC3Q15034 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HERC3Q15034 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HERC3Q15034 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HERC3Q15034 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HERC3Q15034 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HERC3Q15034 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HERC3Q15034 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HERC3Q15034 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HERC3Q15034 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERC3Q15034 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERC3Q15034 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERC3Q15034 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERC3Q15034 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERC3Q15034 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERC3Q15034 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERC3Q15034 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERC3Q15034 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERC3Q15034 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERC3Q15034 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HERC3Q15034 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HERC3Q15034 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HERC3Q15034 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HERC3Q15034 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HERC3Q15034 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HERC3Q15034 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HERC3Q15034 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HERC3Q15034 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HERC3Q15034 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HERC3Q15034 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HERC3Q15034 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HERC3Q15034 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HERC3Q15034 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HERC3Q15034 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HERC3Q15034 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HERC3Q15034 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HERC3Q15034 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.7□□□□□ -2.3
HERC3Q15034 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HERC3Q15034 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HERC3Q15034 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
HERC3Q15034 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HERC3Q15034 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HERC3Q15034 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HERC3Q15034 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HERC3Q15034 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HERC3Q15034 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HERC3Q15034 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HERC3Q15034 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HERC3Q15034 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HERC3Q15034 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HERC3Q15034 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HERC3Q15034 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HERC3Q15034 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HERC3Q15034 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HERC3Q15034 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HERC3Q15034 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HERC3Q15034 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HERC3Q15034 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HERC3Q15034 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HERC3Q15034 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HERC3Q15034 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HERC3Q15034 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HERC3Q15034 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HERC3Q15034 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HERC3Q15034 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HERC3Q15034 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HERC3Q15034 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
HERC3Q15034 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HERC3Q15034 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HERC3Q15034 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HERC3Q15034 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HERC3Q15034 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HERC3Q15034 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HERC3Q15034 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HERC3Q15034 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HERC3Q15034 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HERC3Q15034 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HERC3Q15034 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HERC3Q15034 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HERC3Q15034 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
HERC3Q15034 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HERC3Q15034 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HERC3Q15034 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HERC3Q15034 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HERC3Q15034 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.66□□□□□ -2.3
HERC3Q15034 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
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