Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
COL9A3Q14050 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
COL9A3Q14050 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
COL9A3Q14050 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
COL9A3Q14050 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
COL9A3Q14050 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
COL9A3Q14050 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
COL9A3Q14050 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
COL9A3Q14050 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
COL9A3Q14050 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
COL9A3Q14050 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
COL9A3Q14050 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
COL9A3Q14050 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
COL9A3Q14050 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
COL9A3Q14050 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
COL9A3Q14050 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
COL9A3Q14050 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
COL9A3Q14050 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
COL9A3Q14050 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
COL9A3Q14050 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
COL9A3Q14050 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
COL9A3Q14050 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
COL9A3Q14050 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
COL9A3Q14050 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
COL9A3Q14050 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
COL9A3Q14050 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
COL9A3Q14050 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
COL9A3Q14050 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
COL9A3Q14050 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
COL9A3Q14050 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
COL9A3Q14050 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
COL9A3Q14050 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
COL9A3Q14050 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
COL9A3Q14050 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
COL9A3Q14050 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
COL9A3Q14050 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
COL9A3Q14050 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
COL9A3Q14050 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
COL9A3Q14050 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
COL9A3Q14050 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
COL9A3Q14050 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
COL9A3Q14050 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
COL9A3Q14050 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
COL9A3Q14050 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
COL9A3Q14050 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
COL9A3Q14050 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
COL9A3Q14050 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
COL9A3Q14050 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
COL9A3Q14050 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
COL9A3Q14050 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
COL9A3Q14050 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
COL9A3Q14050 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
COL9A3Q14050 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
COL9A3Q14050 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
COL9A3Q14050 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
COL9A3Q14050 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
COL9A3Q14050 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
COL9A3Q14050 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
COL9A3Q14050 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
COL9A3Q14050 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
COL9A3Q14050 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
COL9A3Q14050 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC2.58□□□□□ -2
COL9A3Q14050 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.58□□□□□ -2
COL9A3Q14050 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.58□□□□□ -2
COL9A3Q14050 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC2.58□□□□□ -2
COL9A3Q14050 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.58□□□□□ -2
COL9A3Q14050 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC2.58□□□□□ -2
COL9A3Q14050 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.58□□□□□ -2
COL9A3Q14050 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
COL9A3Q14050 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.58□□□□□ -2
COL9A3Q14050 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC2.58□□□□□ -2
COL9A3Q14050 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
COL9A3Q14050 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.57□□□□□ -2
COL9A3Q14050 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC2.57□□□□□ -2
COL9A3Q14050 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.57□□□□□ -2
COL9A3Q14050 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC2.57□□□□□ -2
COL9A3Q14050 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.57□□□□□ -2
COL9A3Q14050 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC2.57□□□□□ -2
COL9A3Q14050 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COL9A3Q14050 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COL9A3Q14050 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COL9A3Q14050 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COL9A3Q14050 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COL9A3Q14050 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COL9A3Q14050 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COL9A3Q14050 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
COL9A3Q14050 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
COL9A3Q14050 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
COL9A3Q14050 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
COL9A3Q14050 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.55□□□□□ -2
COL9A3Q14050 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC2.55□□□□□ -2
COL9A3Q14050 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
COL9A3Q14050 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC2.54□□□□□ -2
COL9A3Q14050 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC2.54□□□□□ -2
COL9A3Q14050 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC2.54□□□□□ -2
COL9A3Q14050 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
COL9A3Q14050 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.54□□□□□ -2
COL9A3Q14050 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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