Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
KRR1Q13601 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
KRR1Q13601 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
KRR1Q13601 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
KRR1Q13601 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
KRR1Q13601 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
KRR1Q13601 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
KRR1Q13601 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
KRR1Q13601 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
KRR1Q13601 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-1.27□□□□□ -2.61
KRR1Q13601 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
KRR1Q13601 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
KRR1Q13601 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
KRR1Q13601 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
KRR1Q13601 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
KRR1Q13601 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
KRR1Q13601 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
KRR1Q13601 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
KRR1Q13601 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
KRR1Q13601 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
KRR1Q13601 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
KRR1Q13601 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
KRR1Q13601 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
KRR1Q13601 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC-1.31□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-1.31□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC-1.32□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC-1.33□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
KRR1Q13601 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118 ms