Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PRPF4BQ13523 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PRPF4BQ13523 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PRPF4BQ13523 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PRPF4BQ13523 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
PRPF4BQ13523 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PRPF4BQ13523 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PRPF4BQ13523 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PRPF4BQ13523 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PRPF4BQ13523 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PRPF4BQ13523 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PRPF4BQ13523 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PRPF4BQ13523 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PRPF4BQ13523 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PRPF4BQ13523 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PRPF4BQ13523 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PRPF4BQ13523 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PRPF4BQ13523 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PRPF4BQ13523 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PRPF4BQ13523 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PRPF4BQ13523 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PRPF4BQ13523 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PRPF4BQ13523 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PRPF4BQ13523 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PRPF4BQ13523 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PRPF4BQ13523 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PRPF4BQ13523 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PRPF4BQ13523 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PRPF4BQ13523 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PRPF4BQ13523 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PRPF4BQ13523 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PRPF4BQ13523 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PRPF4BQ13523 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PRPF4BQ13523 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PRPF4BQ13523 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PRPF4BQ13523 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PRPF4BQ13523 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PRPF4BQ13523 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PRPF4BQ13523 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PRPF4BQ13523 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PRPF4BQ13523 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PRPF4BQ13523 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PRPF4BQ13523 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PRPF4BQ13523 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PRPF4BQ13523 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PRPF4BQ13523 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PRPF4BQ13523 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PRPF4BQ13523 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PRPF4BQ13523 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PRPF4BQ13523 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC0.52□□□□□ -2.33
PRPF4BQ13523 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PRPF4BQ13523 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PRPF4BQ13523 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PRPF4BQ13523 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PRPF4BQ13523 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PRPF4BQ13523 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PRPF4BQ13523 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PRPF4BQ13523 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PRPF4BQ13523 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PRPF4BQ13523 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PRPF4BQ13523 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PRPF4BQ13523 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
PRPF4BQ13523 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
PRPF4BQ13523 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PRPF4BQ13523 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PRPF4BQ13523 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PRPF4BQ13523 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PRPF4BQ13523 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PRPF4BQ13523 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
PRPF4BQ13523 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
PRPF4BQ13523 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PRPF4BQ13523 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PRPF4BQ13523 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PRPF4BQ13523 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PRPF4BQ13523 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PRPF4BQ13523 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PRPF4BQ13523 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PRPF4BQ13523 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PRPF4BQ13523 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PRPF4BQ13523 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PRPF4BQ13523 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
PRPF4BQ13523 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PRPF4BQ13523 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PRPF4BQ13523 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PRPF4BQ13523 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
PRPF4BQ13523 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PRPF4BQ13523 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PRPF4BQ13523 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PRPF4BQ13523 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PRPF4BQ13523 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PRPF4BQ13523 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PRPF4BQ13523 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PRPF4BQ13523 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PRPF4BQ13523 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PRPF4BQ13523 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
PRPF4BQ13523 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PRPF4BQ13523 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PRPF4BQ13523 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PRPF4BQ13523 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PRPF4BQ13523 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
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