Protein–RNA interactions for Protein: Q13454

TUSC3, Tumor suppressor candidate 3, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUSC3Q13454 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TUSC3Q13454 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
TUSC3Q13454 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
TUSC3Q13454 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TUSC3Q13454 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TUSC3Q13454 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TUSC3Q13454 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TUSC3Q13454 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TUSC3Q13454 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TUSC3Q13454 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TUSC3Q13454 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TUSC3Q13454 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TUSC3Q13454 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TUSC3Q13454 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TUSC3Q13454 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TUSC3Q13454 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TUSC3Q13454 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TUSC3Q13454 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TUSC3Q13454 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TUSC3Q13454 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TUSC3Q13454 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
TUSC3Q13454 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.81□□□□□ -2.12
TUSC3Q13454 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TUSC3Q13454 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TUSC3Q13454 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TUSC3Q13454 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TUSC3Q13454 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TUSC3Q13454 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TUSC3Q13454 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
TUSC3Q13454 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TUSC3Q13454 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TUSC3Q13454 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TUSC3Q13454 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TUSC3Q13454 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TUSC3Q13454 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TUSC3Q13454 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TUSC3Q13454 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TUSC3Q13454 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TUSC3Q13454 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TUSC3Q13454 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
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TUSC3Q13454 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TUSC3Q13454 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TUSC3Q13454 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TUSC3Q13454 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TUSC3Q13454 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.78□□□□□ -2.12
TUSC3Q13454 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TUSC3Q13454 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TUSC3Q13454 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
TUSC3Q13454 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
TUSC3Q13454 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
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