Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LSAMPQ13449 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LSAMPQ13449 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LSAMPQ13449 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LSAMPQ13449 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LSAMPQ13449 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LSAMPQ13449 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LSAMPQ13449 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LSAMPQ13449 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LSAMPQ13449 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LSAMPQ13449 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LSAMPQ13449 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LSAMPQ13449 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LSAMPQ13449 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LSAMPQ13449 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LSAMPQ13449 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LSAMPQ13449 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
LSAMPQ13449 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
LSAMPQ13449 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
LSAMPQ13449 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
LSAMPQ13449 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
LSAMPQ13449 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
LSAMPQ13449 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
LSAMPQ13449 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
LSAMPQ13449 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
LSAMPQ13449 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
LSAMPQ13449 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
LSAMPQ13449 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
LSAMPQ13449 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
LSAMPQ13449 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
LSAMPQ13449 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
LSAMPQ13449 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC1.73□□□□□ -2.13
LSAMPQ13449 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
LSAMPQ13449 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
LSAMPQ13449 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
LSAMPQ13449 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
LSAMPQ13449 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
LSAMPQ13449 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
LSAMPQ13449 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
LSAMPQ13449 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
LSAMPQ13449 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
LSAMPQ13449 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
LSAMPQ13449 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
LSAMPQ13449 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
LSAMPQ13449 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
LSAMPQ13449 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
LSAMPQ13449 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
LSAMPQ13449 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
LSAMPQ13449 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
LSAMPQ13449 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
LSAMPQ13449 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
LSAMPQ13449 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
LSAMPQ13449 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
LSAMPQ13449 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
LSAMPQ13449 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
LSAMPQ13449 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
LSAMPQ13449 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
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