Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SF3B2Q13435 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SF3B2Q13435 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SF3B2Q13435 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SF3B2Q13435 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SF3B2Q13435 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SF3B2Q13435 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SF3B2Q13435 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SF3B2Q13435 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SF3B2Q13435 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SF3B2Q13435 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SF3B2Q13435 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SF3B2Q13435 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SF3B2Q13435 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SF3B2Q13435 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SF3B2Q13435 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SF3B2Q13435 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SF3B2Q13435 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SF3B2Q13435 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SF3B2Q13435 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SF3B2Q13435 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SF3B2Q13435 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SF3B2Q13435 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SF3B2Q13435 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SF3B2Q13435 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SF3B2Q13435 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SF3B2Q13435 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.02
SF3B2Q13435 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
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