Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
STRN3Q13033 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
STRN3Q13033 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
STRN3Q13033 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
STRN3Q13033 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
STRN3Q13033 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
STRN3Q13033 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
STRN3Q13033 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
STRN3Q13033 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
STRN3Q13033 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
STRN3Q13033 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
STRN3Q13033 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
STRN3Q13033 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
STRN3Q13033 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
STRN3Q13033 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
STRN3Q13033 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
STRN3Q13033 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
STRN3Q13033 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
STRN3Q13033 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
STRN3Q13033 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
STRN3Q13033 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
STRN3Q13033 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
STRN3Q13033 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
STRN3Q13033 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
STRN3Q13033 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
STRN3Q13033 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
STRN3Q13033 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
STRN3Q13033 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
STRN3Q13033 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
STRN3Q13033 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
STRN3Q13033 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
STRN3Q13033 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
STRN3Q13033 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
STRN3Q13033 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
STRN3Q13033 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
STRN3Q13033 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
STRN3Q13033 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
STRN3Q13033 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
STRN3Q13033 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
STRN3Q13033 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
STRN3Q13033 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
STRN3Q13033 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
STRN3Q13033 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
STRN3Q13033 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
STRN3Q13033 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
STRN3Q13033 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
STRN3Q13033 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
STRN3Q13033 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
STRN3Q13033 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
STRN3Q13033 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
STRN3Q13033 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
STRN3Q13033 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
STRN3Q13033 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
STRN3Q13033 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
STRN3Q13033 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
STRN3Q13033 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
STRN3Q13033 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
STRN3Q13033 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
STRN3Q13033 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
STRN3Q13033 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
STRN3Q13033 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
STRN3Q13033 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
STRN3Q13033 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
STRN3Q13033 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
STRN3Q13033 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
STRN3Q13033 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
STRN3Q13033 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
STRN3Q13033 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
STRN3Q13033 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
STRN3Q13033 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
STRN3Q13033 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
STRN3Q13033 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
STRN3Q13033 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
STRN3Q13033 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
STRN3Q13033 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
STRN3Q13033 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
STRN3Q13033 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
STRN3Q13033 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
STRN3Q13033 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
STRN3Q13033 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
STRN3Q13033 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
STRN3Q13033 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
STRN3Q13033 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
STRN3Q13033 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
STRN3Q13033 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
STRN3Q13033 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
STRN3Q13033 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
STRN3Q13033 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
STRN3Q13033 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
STRN3Q13033 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
STRN3Q13033 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
STRN3Q13033 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
STRN3Q13033 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
STRN3Q13033 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
STRN3Q13033 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
STRN3Q13033 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
STRN3Q13033 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
STRN3Q13033 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
STRN3Q13033 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
STRN3Q13033 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
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