Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
TSFMP43897 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TSFMP43897 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TSFMP43897 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TSFMP43897 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TSFMP43897 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TSFMP43897 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TSFMP43897 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TSFMP43897 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TSFMP43897 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TSFMP43897 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TSFMP43897 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TSFMP43897 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TSFMP43897 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TSFMP43897 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TSFMP43897 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TSFMP43897 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TSFMP43897 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TSFMP43897 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TSFMP43897 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TSFMP43897 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TSFMP43897 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TSFMP43897 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TSFMP43897 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TSFMP43897 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TSFMP43897 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
TSFMP43897 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TSFMP43897 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TSFMP43897 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TSFMP43897 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TSFMP43897 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TSFMP43897 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TSFMP43897 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TSFMP43897 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TSFMP43897 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TSFMP43897 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TSFMP43897 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TSFMP43897 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TSFMP43897 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TSFMP43897 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TSFMP43897 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TSFMP43897 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
TSFMP43897 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TSFMP43897 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TSFMP43897 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.8□□□□□ -2.28
TSFMP43897 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TSFMP43897 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TSFMP43897 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TSFMP43897 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TSFMP43897 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TSFMP43897 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TSFMP43897 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TSFMP43897 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TSFMP43897 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TSFMP43897 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TSFMP43897 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TSFMP43897 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TSFMP43897 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TSFMP43897 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TSFMP43897 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
TSFMP43897 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TSFMP43897 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TSFMP43897 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TSFMP43897 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TSFMP43897 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TSFMP43897 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TSFMP43897 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TSFMP43897 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TSFMP43897 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TSFMP43897 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TSFMP43897 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TSFMP43897 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TSFMP43897 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TSFMP43897 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TSFMP43897 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TSFMP43897 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
TSFMP43897 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TSFMP43897 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TSFMP43897 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TSFMP43897 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TSFMP43897 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TSFMP43897 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
TSFMP43897 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TSFMP43897 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TSFMP43897 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
TSFMP43897 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TSFMP43897 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TSFMP43897 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TSFMP43897 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TSFMP43897 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TSFMP43897 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TSFMP43897 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
TSFMP43897 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TSFMP43897 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TSFMP43897 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TSFMP43897 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TSFMP43897 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TSFMP43897 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TSFMP43897 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TSFMP43897 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.7 ms