Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-1.07□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC-1.07□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC-1.09□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
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PTPRDP23468 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC-1.11□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC-1.11□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
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