Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
POLR1AO95602 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
POLR1AO95602 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
POLR1AO95602 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC-2.46□□□□□ -2.8
POLR1AO95602 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
POLR1AO95602 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
POLR1AO95602 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
POLR1AO95602 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
POLR1AO95602 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
POLR1AO95602 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
POLR1AO95602 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
POLR1AO95602 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
POLR1AO95602 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
POLR1AO95602 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
POLR1AO95602 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC-2.47□□□□□ -2.8
POLR1AO95602 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
POLR1AO95602 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
POLR1AO95602 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
POLR1AO95602 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
POLR1AO95602 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
POLR1AO95602 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
POLR1AO95602 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
POLR1AO95602 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
POLR1AO95602 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-2.48□□□□□ -2.81
POLR1AO95602 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC-2.48□□□□□ -2.81
POLR1AO95602 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
POLR1AO95602 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
POLR1AO95602 RNU6-1121P-201ENST00000516802 109 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
POLR1AO95602 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
POLR1AO95602 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
POLR1AO95602 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
POLR1AO95602 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
POLR1AO95602 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
POLR1AO95602 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
POLR1AO95602 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
POLR1AO95602 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
POLR1AO95602 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
POLR1AO95602 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
POLR1AO95602 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
POLR1AO95602 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
POLR1AO95602 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
POLR1AO95602 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
POLR1AO95602 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
POLR1AO95602 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
POLR1AO95602 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
POLR1AO95602 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
POLR1AO95602 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
POLR1AO95602 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
POLR1AO95602 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
POLR1AO95602 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
POLR1AO95602 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
POLR1AO95602 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
POLR1AO95602 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
POLR1AO95602 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
POLR1AO95602 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
POLR1AO95602 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
POLR1AO95602 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
POLR1AO95602 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
POLR1AO95602 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
POLR1AO95602 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
POLR1AO95602 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
POLR1AO95602 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
POLR1AO95602 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
POLR1AO95602 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
POLR1AO95602 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
POLR1AO95602 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
POLR1AO95602 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
POLR1AO95602 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
POLR1AO95602 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
POLR1AO95602 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
POLR1AO95602 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
POLR1AO95602 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
POLR1AO95602 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
POLR1AO95602 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC-2.54□□□□□ -2.82
POLR1AO95602 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
POLR1AO95602 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
POLR1AO95602 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
POLR1AO95602 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
POLR1AO95602 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
POLR1AO95602 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
POLR1AO95602 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
POLR1AO95602 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
POLR1AO95602 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
POLR1AO95602 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
POLR1AO95602 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
POLR1AO95602 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
POLR1AO95602 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
POLR1AO95602 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
POLR1AO95602 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
POLR1AO95602 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
POLR1AO95602 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
POLR1AO95602 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
POLR1AO95602 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
POLR1AO95602 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC-2.57□□□□□ -2.82
POLR1AO95602 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
POLR1AO95602 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
POLR1AO95602 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
POLR1AO95602 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
POLR1AO95602 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
POLR1AO95602 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
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