Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SOBPA7XYQ1 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SOBPA7XYQ1 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SOBPA7XYQ1 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SOBPA7XYQ1 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SOBPA7XYQ1 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SOBPA7XYQ1 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SOBPA7XYQ1 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SOBPA7XYQ1 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SOBPA7XYQ1 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SOBPA7XYQ1 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SOBPA7XYQ1 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SOBPA7XYQ1 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SOBPA7XYQ1 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SOBPA7XYQ1 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SOBPA7XYQ1 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SOBPA7XYQ1 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SOBPA7XYQ1 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SOBPA7XYQ1 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SOBPA7XYQ1 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SOBPA7XYQ1 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SOBPA7XYQ1 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SOBPA7XYQ1 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SOBPA7XYQ1 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SOBPA7XYQ1 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SOBPA7XYQ1 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SOBPA7XYQ1 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SOBPA7XYQ1 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SOBPA7XYQ1 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SOBPA7XYQ1 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SOBPA7XYQ1 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SOBPA7XYQ1 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SOBPA7XYQ1 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SOBPA7XYQ1 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SOBPA7XYQ1 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SOBPA7XYQ1 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SOBPA7XYQ1 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SOBPA7XYQ1 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SOBPA7XYQ1 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SOBPA7XYQ1 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SOBPA7XYQ1 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SOBPA7XYQ1 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SOBPA7XYQ1 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SOBPA7XYQ1 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SOBPA7XYQ1 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SOBPA7XYQ1 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SOBPA7XYQ1 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SOBPA7XYQ1 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SOBPA7XYQ1 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SOBPA7XYQ1 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SOBPA7XYQ1 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SOBPA7XYQ1 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SOBPA7XYQ1 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SOBPA7XYQ1 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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