Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
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VAX2Q9UIW0 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
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