Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

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Length 2,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC0□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
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CCDC88CQ9P219 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
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CCDC88CQ9P219 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
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CCDC88CQ9P219 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
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CCDC88CQ9P219 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
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CCDC88CQ9P219 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
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CCDC88CQ9P219 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
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