Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXC10Q9NYD6 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXC10Q9NYD6 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXC10Q9NYD6 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXC10Q9NYD6 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXC10Q9NYD6 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXC10Q9NYD6 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXC10Q9NYD6 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXC10Q9NYD6 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXC10Q9NYD6 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXC10Q9NYD6 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXC10Q9NYD6 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXC10Q9NYD6 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXC10Q9NYD6 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXC10Q9NYD6 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXC10Q9NYD6 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXC10Q9NYD6 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXC10Q9NYD6 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXC10Q9NYD6 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXC10Q9NYD6 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXC10Q9NYD6 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.16□□□□□ -2.38
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HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HOXC10Q9NYD6 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HOXC10Q9NYD6 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HOXC10Q9NYD6 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HOXC10Q9NYD6 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HOXC10Q9NYD6 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HOXC10Q9NYD6 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HOXC10Q9NYD6 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HOXC10Q9NYD6 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
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HOXC10Q9NYD6 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
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HOXC10Q9NYD6 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
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HOXC10Q9NYD6 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
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HOXC10Q9NYD6 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
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HOXC10Q9NYD6 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HOXC10Q9NYD6 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
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HOXC10Q9NYD6 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HOXC10Q9NYD6 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HOXC10Q9NYD6 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
HOXC10Q9NYD6 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HOXC10Q9NYD6 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HOXC10Q9NYD6 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HOXC10Q9NYD6 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
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