Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.14□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC0.14□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC0.11□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.11□□□□□ -2.39
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