Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.18□□□□□ -2.44
CCDC47Q96A33 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CCDC47Q96A33 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CCDC47Q96A33 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CCDC47Q96A33 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CCDC47Q96A33 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CCDC47Q96A33 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CCDC47Q96A33 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CCDC47Q96A33 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CCDC47Q96A33 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CCDC47Q96A33 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CCDC47Q96A33 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CCDC47Q96A33 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CCDC47Q96A33 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CCDC47Q96A33 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CCDC47Q96A33 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CCDC47Q96A33 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CCDC47Q96A33 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CCDC47Q96A33 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CCDC47Q96A33 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CCDC47Q96A33 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CCDC47Q96A33 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CCDC47Q96A33 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CCDC47Q96A33 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
CCDC47Q96A33 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CCDC47Q96A33 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CCDC47Q96A33 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CCDC47Q96A33 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CCDC47Q96A33 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CCDC47Q96A33 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CCDC47Q96A33 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CCDC47Q96A33 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CCDC47Q96A33 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CCDC47Q96A33 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CCDC47Q96A33 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CCDC47Q96A33 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CCDC47Q96A33 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CCDC47Q96A33 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CCDC47Q96A33 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CCDC47Q96A33 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CCDC47Q96A33 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CCDC47Q96A33 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CCDC47Q96A33 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CCDC47Q96A33 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CCDC47Q96A33 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CCDC47Q96A33 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CCDC47Q96A33 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CCDC47Q96A33 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CCDC47Q96A33 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CCDC47Q96A33 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CCDC47Q96A33 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CCDC47Q96A33 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CCDC47Q96A33 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CCDC47Q96A33 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CCDC47Q96A33 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CCDC47Q96A33 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CCDC47Q96A33 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CCDC47Q96A33 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
CCDC47Q96A33 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CCDC47Q96A33 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CCDC47Q96A33 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CCDC47Q96A33 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CCDC47Q96A33 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CCDC47Q96A33 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CCDC47Q96A33 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CCDC47Q96A33 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CCDC47Q96A33 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
CCDC47Q96A33 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
CCDC47Q96A33 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CCDC47Q96A33 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CCDC47Q96A33 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CCDC47Q96A33 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CCDC47Q96A33 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CCDC47Q96A33 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CCDC47Q96A33 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CCDC47Q96A33 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CCDC47Q96A33 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CCDC47Q96A33 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CCDC47Q96A33 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CCDC47Q96A33 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CCDC47Q96A33 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CCDC47Q96A33 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CCDC47Q96A33 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CCDC47Q96A33 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
CCDC47Q96A33 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CCDC47Q96A33 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CCDC47Q96A33 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CCDC47Q96A33 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CCDC47Q96A33 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CCDC47Q96A33 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CCDC47Q96A33 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CCDC47Q96A33 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CCDC47Q96A33 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CCDC47Q96A33 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CCDC47Q96A33 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CCDC47Q96A33 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CCDC47Q96A33 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CCDC47Q96A33 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CCDC47Q96A33 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CCDC47Q96A33 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177.9 ms