Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNF548Q8NEK5 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF548Q8NEK5 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF548Q8NEK5 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF548Q8NEK5 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF548Q8NEK5 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF548Q8NEK5 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF548Q8NEK5 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF548Q8NEK5 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF548Q8NEK5 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF548Q8NEK5 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF548Q8NEK5 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF548Q8NEK5 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF548Q8NEK5 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF548Q8NEK5 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF548Q8NEK5 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF548Q8NEK5 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
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