Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR2

NLRC3, NLR family CARD domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3Q7RTR2 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NLRC3Q7RTR2 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NLRC3Q7RTR2 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NLRC3Q7RTR2 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NLRC3Q7RTR2 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
NLRC3Q7RTR2 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NLRC3Q7RTR2 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NLRC3Q7RTR2 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NLRC3Q7RTR2 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NLRC3Q7RTR2 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
NLRC3Q7RTR2 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NLRC3Q7RTR2 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NLRC3Q7RTR2 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NLRC3Q7RTR2 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NLRC3Q7RTR2 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NLRC3Q7RTR2 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NLRC3Q7RTR2 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NLRC3Q7RTR2 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NLRC3Q7RTR2 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NLRC3Q7RTR2 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NLRC3Q7RTR2 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NLRC3Q7RTR2 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NLRC3Q7RTR2 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
NLRC3Q7RTR2 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.09
NLRC3Q7RTR2 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NLRC3Q7RTR2 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NLRC3Q7RTR2 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NLRC3Q7RTR2 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NLRC3Q7RTR2 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NLRC3Q7RTR2 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NLRC3Q7RTR2 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NLRC3Q7RTR2 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NLRC3Q7RTR2 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NLRC3Q7RTR2 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NLRC3Q7RTR2 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NLRC3Q7RTR2 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NLRC3Q7RTR2 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NLRC3Q7RTR2 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NLRC3Q7RTR2 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
NLRC3Q7RTR2 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NLRC3Q7RTR2 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NLRC3Q7RTR2 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NLRC3Q7RTR2 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NLRC3Q7RTR2 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NLRC3Q7RTR2 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
NLRC3Q7RTR2 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
NLRC3Q7RTR2 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NLRC3Q7RTR2 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NLRC3Q7RTR2 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
NLRC3Q7RTR2 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
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NLRC3Q7RTR2 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
NLRC3Q7RTR2 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NLRC3Q7RTR2 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NLRC3Q7RTR2 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
NLRC3Q7RTR2 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NLRC3Q7RTR2 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NLRC3Q7RTR2 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NLRC3Q7RTR2 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NLRC3Q7RTR2 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NLRC3Q7RTR2 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NLRC3Q7RTR2 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NLRC3Q7RTR2 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.92□□□□□ -2.1
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NLRC3Q7RTR2 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NLRC3Q7RTR2 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NLRC3Q7RTR2 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
NLRC3Q7RTR2 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NLRC3Q7RTR2 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NLRC3Q7RTR2 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NLRC3Q7RTR2 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NLRC3Q7RTR2 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NLRC3Q7RTR2 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
NLRC3Q7RTR2 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NLRC3Q7RTR2 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NLRC3Q7RTR2 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NLRC3Q7RTR2 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
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