Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TPRNQ4KMQ1 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TPRNQ4KMQ1 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TPRNQ4KMQ1 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TPRNQ4KMQ1 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TPRNQ4KMQ1 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TPRNQ4KMQ1 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TPRNQ4KMQ1 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TPRNQ4KMQ1 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TPRNQ4KMQ1 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TPRNQ4KMQ1 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TPRNQ4KMQ1 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TPRNQ4KMQ1 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TPRNQ4KMQ1 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TPRNQ4KMQ1 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TPRNQ4KMQ1 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TPRNQ4KMQ1 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TPRNQ4KMQ1 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TPRNQ4KMQ1 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TPRNQ4KMQ1 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TPRNQ4KMQ1 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
TPRNQ4KMQ1 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TPRNQ4KMQ1 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TPRNQ4KMQ1 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TPRNQ4KMQ1 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TPRNQ4KMQ1 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TPRNQ4KMQ1 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TPRNQ4KMQ1 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TPRNQ4KMQ1 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TPRNQ4KMQ1 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TPRNQ4KMQ1 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TPRNQ4KMQ1 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TPRNQ4KMQ1 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TPRNQ4KMQ1 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TPRNQ4KMQ1 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TPRNQ4KMQ1 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TPRNQ4KMQ1 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TPRNQ4KMQ1 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TPRNQ4KMQ1 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TPRNQ4KMQ1 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TPRNQ4KMQ1 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TPRNQ4KMQ1 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TPRNQ4KMQ1 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TPRNQ4KMQ1 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TPRNQ4KMQ1 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TPRNQ4KMQ1 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TPRNQ4KMQ1 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TPRNQ4KMQ1 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TPRNQ4KMQ1 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TPRNQ4KMQ1 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TPRNQ4KMQ1 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TPRNQ4KMQ1 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TPRNQ4KMQ1 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TPRNQ4KMQ1 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
TPRNQ4KMQ1 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TPRNQ4KMQ1 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TPRNQ4KMQ1 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TPRNQ4KMQ1 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TPRNQ4KMQ1 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TPRNQ4KMQ1 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
TPRNQ4KMQ1 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TPRNQ4KMQ1 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TPRNQ4KMQ1 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TPRNQ4KMQ1 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TPRNQ4KMQ1 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TPRNQ4KMQ1 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TPRNQ4KMQ1 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TPRNQ4KMQ1 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TPRNQ4KMQ1 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TPRNQ4KMQ1 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TPRNQ4KMQ1 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TPRNQ4KMQ1 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TPRNQ4KMQ1 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TPRNQ4KMQ1 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TPRNQ4KMQ1 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TPRNQ4KMQ1 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TPRNQ4KMQ1 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TPRNQ4KMQ1 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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