Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SWI5Q1ZZU3 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SWI5Q1ZZU3 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SWI5Q1ZZU3 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
SWI5Q1ZZU3 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
SWI5Q1ZZU3 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SWI5Q1ZZU3 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SWI5Q1ZZU3 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
SWI5Q1ZZU3 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
SWI5Q1ZZU3 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SWI5Q1ZZU3 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SWI5Q1ZZU3 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SWI5Q1ZZU3 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SWI5Q1ZZU3 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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