Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
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