Protein–RNA interactions for Protein: Q16825

PTPN21, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 21, humanhuman

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Length 1,174 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN21Q16825 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPN21Q16825 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPN21Q16825 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPN21Q16825 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPN21Q16825 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPN21Q16825 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPN21Q16825 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPN21Q16825 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPN21Q16825 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPN21Q16825 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPN21Q16825 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPN21Q16825 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPN21Q16825 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPN21Q16825 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPN21Q16825 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPN21Q16825 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPN21Q16825 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPN21Q16825 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPN21Q16825 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPN21Q16825 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPN21Q16825 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPN21Q16825 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPN21Q16825 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPN21Q16825 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPN21Q16825 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPN21Q16825 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPN21Q16825 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPN21Q16825 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPN21Q16825 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPN21Q16825 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPN21Q16825 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPN21Q16825 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPN21Q16825 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPN21Q16825 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPN21Q16825 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPN21Q16825 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPN21Q16825 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPN21Q16825 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPN21Q16825 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPN21Q16825 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPN21Q16825 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPN21Q16825 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPN21Q16825 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPN21Q16825 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPN21Q16825 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPN21Q16825 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPN21Q16825 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPN21Q16825 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPN21Q16825 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPN21Q16825 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPN21Q16825 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPN21Q16825 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPN21Q16825 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPN21Q16825 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPN21Q16825 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPN21Q16825 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPN21Q16825 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPN21Q16825 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPN21Q16825 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPN21Q16825 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPN21Q16825 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPN21Q16825 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPN21Q16825 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPN21Q16825 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPN21Q16825 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPN21Q16825 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPN21Q16825 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPN21Q16825 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPN21Q16825 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPN21Q16825 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPN21Q16825 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPN21Q16825 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPN21Q16825 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPN21Q16825 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPN21Q16825 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPN21Q16825 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPN21Q16825 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPN21Q16825 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPN21Q16825 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPN21Q16825 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPN21Q16825 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPN21Q16825 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPN21Q16825 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPN21Q16825 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPN21Q16825 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPN21Q16825 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPN21Q16825 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPN21Q16825 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPN21Q16825 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPN21Q16825 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPN21Q16825 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPN21Q16825 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPN21Q16825 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPN21Q16825 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPN21Q16825 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPN21Q16825 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPN21Q16825 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPN21Q16825 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPN21Q16825 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPN21Q16825 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
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