Protein–RNA interactions for Protein: Q16558

KCNMB1, Calcium-activated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB1Q16558 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KCNMB1Q16558 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KCNMB1Q16558 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KCNMB1Q16558 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KCNMB1Q16558 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KCNMB1Q16558 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KCNMB1Q16558 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KCNMB1Q16558 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KCNMB1Q16558 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KCNMB1Q16558 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KCNMB1Q16558 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KCNMB1Q16558 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KCNMB1Q16558 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KCNMB1Q16558 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KCNMB1Q16558 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KCNMB1Q16558 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KCNMB1Q16558 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KCNMB1Q16558 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KCNMB1Q16558 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KCNMB1Q16558 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KCNMB1Q16558 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KCNMB1Q16558 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KCNMB1Q16558 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KCNMB1Q16558 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KCNMB1Q16558 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KCNMB1Q16558 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
KCNMB1Q16558 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KCNMB1Q16558 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KCNMB1Q16558 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KCNMB1Q16558 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KCNMB1Q16558 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KCNMB1Q16558 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KCNMB1Q16558 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KCNMB1Q16558 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KCNMB1Q16558 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KCNMB1Q16558 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KCNMB1Q16558 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KCNMB1Q16558 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KCNMB1Q16558 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KCNMB1Q16558 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KCNMB1Q16558 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KCNMB1Q16558 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KCNMB1Q16558 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KCNMB1Q16558 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KCNMB1Q16558 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KCNMB1Q16558 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KCNMB1Q16558 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KCNMB1Q16558 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KCNMB1Q16558 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KCNMB1Q16558 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KCNMB1Q16558 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KCNMB1Q16558 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KCNMB1Q16558 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KCNMB1Q16558 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KCNMB1Q16558 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KCNMB1Q16558 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KCNMB1Q16558 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KCNMB1Q16558 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KCNMB1Q16558 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KCNMB1Q16558 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KCNMB1Q16558 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KCNMB1Q16558 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KCNMB1Q16558 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KCNMB1Q16558 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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KCNMB1Q16558 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KCNMB1Q16558 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KCNMB1Q16558 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KCNMB1Q16558 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KCNMB1Q16558 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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KCNMB1Q16558 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KCNMB1Q16558 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KCNMB1Q16558 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KCNMB1Q16558 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KCNMB1Q16558 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KCNMB1Q16558 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KCNMB1Q16558 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KCNMB1Q16558 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KCNMB1Q16558 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KCNMB1Q16558 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KCNMB1Q16558 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KCNMB1Q16558 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KCNMB1Q16558 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KCNMB1Q16558 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KCNMB1Q16558 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KCNMB1Q16558 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KCNMB1Q16558 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KCNMB1Q16558 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KCNMB1Q16558 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KCNMB1Q16558 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KCNMB1Q16558 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KCNMB1Q16558 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KCNMB1Q16558 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KCNMB1Q16558 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KCNMB1Q16558 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KCNMB1Q16558 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KCNMB1Q16558 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KCNMB1Q16558 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
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