Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RPE65Q16518 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RPE65Q16518 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
RPE65Q16518 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RPE65Q16518 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RPE65Q16518 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RPE65Q16518 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RPE65Q16518 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
RPE65Q16518 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RPE65Q16518 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RPE65Q16518 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RPE65Q16518 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RPE65Q16518 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RPE65Q16518 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RPE65Q16518 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RPE65Q16518 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RPE65Q16518 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RPE65Q16518 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RPE65Q16518 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RPE65Q16518 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
RPE65Q16518 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
RPE65Q16518 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RPE65Q16518 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RPE65Q16518 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RPE65Q16518 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RPE65Q16518 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RPE65Q16518 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RPE65Q16518 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
RPE65Q16518 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RPE65Q16518 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RPE65Q16518 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RPE65Q16518 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RPE65Q16518 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RPE65Q16518 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RPE65Q16518 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RPE65Q16518 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RPE65Q16518 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RPE65Q16518 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RPE65Q16518 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
RPE65Q16518 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RPE65Q16518 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RPE65Q16518 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RPE65Q16518 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RPE65Q16518 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RPE65Q16518 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RPE65Q16518 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RPE65Q16518 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RPE65Q16518 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RPE65Q16518 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RPE65Q16518 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RPE65Q16518 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RPE65Q16518 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RPE65Q16518 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RPE65Q16518 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
RPE65Q16518 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
RPE65Q16518 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RPE65Q16518 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RPE65Q16518 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RPE65Q16518 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RPE65Q16518 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RPE65Q16518 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RPE65Q16518 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RPE65Q16518 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
RPE65Q16518 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RPE65Q16518 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RPE65Q16518 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RPE65Q16518 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RPE65Q16518 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RPE65Q16518 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RPE65Q16518 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RPE65Q16518 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RPE65Q16518 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RPE65Q16518 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RPE65Q16518 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RPE65Q16518 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RPE65Q16518 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RPE65Q16518 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
RPE65Q16518 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RPE65Q16518 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RPE65Q16518 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RPE65Q16518 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RPE65Q16518 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RPE65Q16518 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RPE65Q16518 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RPE65Q16518 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RPE65Q16518 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RPE65Q16518 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
RPE65Q16518 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RPE65Q16518 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RPE65Q16518 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RPE65Q16518 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RPE65Q16518 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RPE65Q16518 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RPE65Q16518 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RPE65Q16518 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RPE65Q16518 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RPE65Q16518 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RPE65Q16518 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RPE65Q16518 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RPE65Q16518 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
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