Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PKN1Q16512 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PKN1Q16512 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PKN1Q16512 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PKN1Q16512 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PKN1Q16512 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PKN1Q16512 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PKN1Q16512 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PKN1Q16512 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
PKN1Q16512 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PKN1Q16512 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PKN1Q16512 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PKN1Q16512 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PKN1Q16512 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PKN1Q16512 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PKN1Q16512 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PKN1Q16512 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PKN1Q16512 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PKN1Q16512 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PKN1Q16512 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PKN1Q16512 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PKN1Q16512 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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