Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SNCBQ16143 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SNCBQ16143 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SNCBQ16143 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SNCBQ16143 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SNCBQ16143 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SNCBQ16143 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SNCBQ16143 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SNCBQ16143 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SNCBQ16143 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC-1.23□□□□□ -2.61
SNCBQ16143 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SNCBQ16143 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SNCBQ16143 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SNCBQ16143 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SNCBQ16143 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SNCBQ16143 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SNCBQ16143 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SNCBQ16143 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SNCBQ16143 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SNCBQ16143 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SNCBQ16143 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SNCBQ16143 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SNCBQ16143 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SNCBQ16143 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SNCBQ16143 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SNCBQ16143 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SNCBQ16143 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SNCBQ16143 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SNCBQ16143 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SNCBQ16143 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SNCBQ16143 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SNCBQ16143 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SNCBQ16143 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SNCBQ16143 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SNCBQ16143 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SNCBQ16143 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SNCBQ16143 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SNCBQ16143 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SNCBQ16143 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SNCBQ16143 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SNCBQ16143 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SNCBQ16143 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SNCBQ16143 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SNCBQ16143 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SNCBQ16143 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SNCBQ16143 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SNCBQ16143 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SNCBQ16143 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SNCBQ16143 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SNCBQ16143 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SNCBQ16143 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SNCBQ16143 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SNCBQ16143 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SNCBQ16143 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SNCBQ16143 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SNCBQ16143 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC-1.28□□□□□ -2.61
SNCBQ16143 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SNCBQ16143 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SNCBQ16143 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SNCBQ16143 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SNCBQ16143 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SNCBQ16143 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SNCBQ16143 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SNCBQ16143 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC-1.28□□□□□ -2.61
SNCBQ16143 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC-1.28□□□□□ -2.61
SNCBQ16143 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SNCBQ16143 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SNCBQ16143 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SNCBQ16143 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC-1.29□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC-1.3□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 205.6 ms