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Protein–RNA interactions for Protein: Q16143
SNCB, Beta-synuclein, human
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
SNCB
Q16143
SNORD115-25-201
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82 nt
BASIC
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□□□□□ -2.61
SNCB
Q16143
Y_RNA.351-201
ENST00000365436
96 nt
BASIC
-1.23
□□□□□ -2.61
SNCB
Q16143
Y_RNA.377-201
ENST00000365644
108 nt
BASIC
-1.23
□□□□□ -2.61
SNCB
Q16143
Y_RNA.407-201
ENST00000383986
113 nt
BASIC
-1.23
□□□□□ -2.61
SNCB
Q16143
MIR617-201
ENST00000385030
97 nt
BASIC
-1.23
□□□□□ -2.61
SNCB
Q16143
MIR652-201
ENST00000385278
98 nt
BASIC
-1.23
□□□□□ -2.61
SNCB
Q16143
RNU6-397P-201
ENST00000516226
104 nt
BASIC
-1.23
□□□□□ -2.61
SNCB
Q16143
RNA5SP33-201
ENST00000516687
98 nt
BASIC
-1.23
□□□□□ -2.61
SNCB
Q16143
AC100767.1-201
ENST00000528178
123 nt
BASIC
-1.23
□□□□□ -2.61
SNCB
Q16143
AP005120.1-201
ENST00000579321
352 nt
TSL 3
BASIC
-1.23
□□□□□ -2.61
SNCB
Q16143
MIR4324-201
ENST00000584846
72 nt
BASIC
-1.23
□□□□□ -2.61
SNCB
Q16143
Z69908.1-201
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247 nt
BASIC
-1.23
□□□□□ -2.61
SNCB
Q16143
AC021613.1-201
ENST00000623880
111 nt
BASIC
-1.23
□□□□□ -2.61
SNCB
Q16143
RNU6-905P-201
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107 nt
BASIC
-1.24
□□□□□ -2.61
SNCB
Q16143
MIR635-201
ENST00000384830
98 nt
BASIC
-1.24
□□□□□ -2.61
SNCB
Q16143
AC244090.1-201
ENST00000441884
93 nt
BASIC
-1.24
□□□□□ -2.61
SNCB
Q16143
Y_RNA.171-201
ENST00000363760
102 nt
BASIC
-1.25
□□□□□ -2.61
SNCB
Q16143
SNORD114-15-201
ENST00000364687
72 nt
BASIC
-1.25
□□□□□ -2.61
SNCB
Q16143
RNU6-571P-201
ENST00000384128
107 nt
BASIC
-1.25
□□□□□ -2.61
SNCB
Q16143
Y_RNA.470-201
ENST00000384307
117 nt
BASIC
-1.25
□□□□□ -2.61
SNCB
Q16143
MTATP6P23-201
ENST00000440153
476 nt
BASIC
-1.25
□□□□□ -2.61
SNCB
Q16143
RNU7-195P-201
ENST00000458793
62 nt
BASIC
-1.25
□□□□□ -2.61
SNCB
Q16143
RNU4ATAC4P-201
ENST00000516307
126 nt
BASIC
-1.25
□□□□□ -2.61
SNCB
Q16143
RNU1-54P-201
ENST00000517181
120 nt
BASIC
-1.25
□□□□□ -2.61
SNCB
Q16143
AP003733.2-201
ENST00000529409
171 nt
BASIC
-1.25
□□□□□ -2.61
SNCB
Q16143
MIR4306-201
ENST00000583390
91 nt
BASIC
-1.25
□□□□□ -2.61
SNCB
Q16143
AC098479.1-201
ENST00000609225
154 nt
BASIC
-1.25
□□□□□ -2.61
SNCB
Q16143
ST7-AS1_1.1-201
ENST00000611142
116 nt
BASIC
-1.25
□□□□□ -2.61
SNCB
Q16143
AC073114.1-201
ENST00000612027
490 nt
BASIC
-1.25
□□□□□ -2.61
SNCB
Q16143
RNY3P4-201
ENST00000384428
101 nt
BASIC
-1.26
□□□□□ -2.61
SNCB
Q16143
RNU6-24P-201
ENST00000384440
107 nt
BASIC
-1.26
□□□□□ -2.61
SNCB
Q16143
Y_RNA.592-201
ENST00000410274
109 nt
BASIC
-1.26
□□□□□ -2.61
SNCB
Q16143
RNU6-1148P-201
ENST00000410992
104 nt
BASIC
-1.26
□□□□□ -2.61
SNCB
Q16143
SNORD67.1-201
ENST00000516618
108 nt
BASIC
-1.26
□□□□□ -2.61
SNCB
Q16143
SNORA40.17-201
ENST00000517256
115 nt
BASIC
-1.26
□□□□□ -2.61
SNCB
Q16143
MIR4460-201
ENST00000577862
86 nt
BASIC
-1.26
□□□□□ -2.61
SNCB
Q16143
MIR4662B-201
ENST00000579498
81 nt
BASIC
-1.26
□□□□□ -2.61
SNCB
Q16143
MIR4659A-201
ENST00000580269
81 nt
BASIC
-1.26
□□□□□ -2.61
SNCB
Q16143
MTRNR2L2-201
ENST00000604882
87 nt
BASIC
-1.26
□□□□□ -2.61
SNCB
Q16143
MIR6128-201
ENST00000615528
109 nt
BASIC
-1.26
□□□□□ -2.61
SNCB
Q16143
SNORD74.6-201
ENST00000364796
70 nt
BASIC
-1.27
□□□□□ -2.61
SNCB
Q16143
SNORA75-201
ENST00000384158
137 nt
BASIC
-1.27
□□□□□ -2.61
SNCB
Q16143
RNU6-524P-201
ENST00000384270
107 nt
BASIC
-1.27
□□□□□ -2.61
SNCB
Q16143
Y_RNA.785-201
ENST00000384290
109 nt
BASIC
-1.27
□□□□□ -2.61
SNCB
Q16143
AC097510.1-201
ENST00000510945
133 nt
BASIC
-1.27
□□□□□ -2.61
SNCB
Q16143
MTCO2P24-201
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426 nt
BASIC
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□□□□□ -2.61
SNCB
Q16143
RNU6-864P-201
ENST00000516256
108 nt
BASIC
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□□□□□ -2.61
SNCB
Q16143
RN7SKP299-201
ENST00000606679
301 nt
BASIC
-1.27
□□□□□ -2.61
SNCB
Q16143
RNU7-10P-201
ENST00000607194
63 nt
BASIC
-1.27
□□□□□ -2.61
SNCB
Q16143
MIR6854-201
ENST00000614935
69 nt
BASIC
-1.27
□□□□□ -2.61
SNCB
Q16143
RNU6-1260P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.61
SNCB
Q16143
Y_RNA.91-201
ENST00000363042
107 nt
BASIC
-1.28
□□□□□ -2.61
SNCB
Q16143
Y_RNA.594-201
ENST00000410373
140 nt
BASIC
-1.28
□□□□□ -2.61
SNCB
Q16143
SEPT14P3-201
ENST00000439401
183 nt
BASIC
-1.28
□□□□□ -2.61
SNCB
Q16143
AL353813.1-201
ENST00000440700
253 nt
BASIC
-1.28
□□□□□ -2.61
SNCB
Q16143
AL360091.3-201
ENST00000442146
387 nt
TSL 5
BASIC
-1.28
□□□□□ -2.61
SNCB
Q16143
AL732372.2-207
ENST00000445840
183 nt
BASIC
-1.28
□□□□□ -2.61
SNCB
Q16143
SEPT14P2-201
ENST00000453405
183 nt
BASIC
-1.28
□□□□□ -2.61
SNCB
Q16143
SEPT14P4-201
ENST00000513445
186 nt
BASIC
-1.28
□□□□□ -2.61
SNCB
Q16143
RNU6-365P-201
ENST00000517113
106 nt
BASIC
-1.28
□□□□□ -2.61
SNCB
Q16143
FO082796.1-201
ENST00000523795
183 nt
BASIC
-1.28
□□□□□ -2.61
SNCB
Q16143
AC040926.1-201
ENST00000530195
238 nt
BASIC
-1.28
□□□□□ -2.61
SNCB
Q16143
AC007012.1-201
ENST00000567192
175 nt
BASIC
-1.28
□□□□□ -2.61
SNCB
Q16143
LUZP6-201
ENST00000589735
177 nt
APPRIS P1
BASIC
-1.28
□□□□□ -2.61
SNCB
Q16143
Z84484.1-202
ENST00000612718
60 nt
TSL 5
BASIC
-1.28
□□□□□ -2.61
SNCB
Q16143
MIR6738-201
ENST00000619620
64 nt
BASIC
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□□□□□ -2.61
SNCB
Q16143
AL669831.3-213
ENST00000636676
183 nt
BASIC
-1.28
□□□□□ -2.61
SNCB
Q16143
TPTEP1-208
ENST00000636884
213 nt
BASIC
-1.28
□□□□□ -2.61
SNCB
Q16143
SNORD115-2-201
ENST00000362842
82 nt
BASIC
-1.29
□□□□□ -2.62
SNCB
Q16143
MIR582-201
ENST00000365731
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BASIC
-1.29
□□□□□ -2.62
SNCB
Q16143
SNORD115-47-201
ENST00000391226
86 nt
BASIC
-1.29
□□□□□ -2.62
SNCB
Q16143
RNU6-908P-201
ENST00000410160
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BASIC
-1.29
□□□□□ -2.62
SNCB
Q16143
RNU6-1156P-201
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100 nt
BASIC
-1.29
□□□□□ -2.62
SNCB
Q16143
AC016907.1-201
ENST00000419483
435 nt
BASIC
-1.29
□□□□□ -2.62
SNCB
Q16143
AL357793.1-201
ENST00000448412
401 nt
TSL 5
BASIC
-1.29
□□□□□ -2.62
SNCB
Q16143
MIR2113-201
ENST00000459007
91 nt
BASIC
-1.29
□□□□□ -2.62
SNCB
Q16143
MIR1270-201
ENST00000459320
83 nt
BASIC
-1.29
□□□□□ -2.62
SNCB
Q16143
RNU7-106P-201
ENST00000459514
67 nt
BASIC
-1.29
□□□□□ -2.62
SNCB
Q16143
SERF1AP1-201
ENST00000514575
187 nt
BASIC
-1.29
□□□□□ -2.62
SNCB
Q16143
Y_RNA.809-201
ENST00000516058
95 nt
BASIC
-1.29
□□□□□ -2.62
SNCB
Q16143
MIR5197-201
ENST00000583721
112 nt
BASIC
-1.29
□□□□□ -2.62
SNCB
Q16143
RNU6-1085P-201
ENST00000363576
107 nt
BASIC
-1.3
□□□□□ -2.62
SNCB
Q16143
Y_RNA.294-201
ENST00000364916
102 nt
BASIC
-1.3
□□□□□ -2.62
SNCB
Q16143
Y_RNA.304-201
ENST00000365011
112 nt
BASIC
-1.3
□□□□□ -2.62
SNCB
Q16143
Y_RNA.331-201
ENST00000365267
102 nt
BASIC
-1.3
□□□□□ -2.62
SNCB
Q16143
SNORA51.5-201
ENST00000384126
131 nt
BASIC
-1.3
□□□□□ -2.62
SNCB
Q16143
SNORD78.2-201
ENST00000391076
69 nt
BASIC
-1.3
□□□□□ -2.62
SNCB
Q16143
SNORA53-201
ENST00000391141
249 nt
BASIC
-1.3
□□□□□ -2.62
SNCB
Q16143
SNORD63B-201
ENST00000411005
70 nt
BASIC
-1.3
□□□□□ -2.62
SNCB
Q16143
AJ239322.2-201
ENST00000421696
575 nt
TSL 5
BASIC
-1.3
□□□□□ -2.62
SNCB
Q16143
AL445567.1-201
ENST00000439121
144 nt
BASIC
-1.3
□□□□□ -2.62
SNCB
Q16143
RNY1P9-201
ENST00000532431
109 nt
BASIC
-1.3
□□□□□ -2.62
SNCB
Q16143
AC024909.2-201
ENST00000553035
286 nt
BASIC
-1.3
□□□□□ -2.62
SNCB
Q16143
AC005014.3-201
ENST00000605985
190 nt
BASIC
-1.3
□□□□□ -2.62
SNCB
Q16143
RNU6-451P-201
ENST00000362921
107 nt
BASIC
-1.31
□□□□□ -2.62
SNCB
Q16143
RNU6-99P-201
ENST00000364721
107 nt
BASIC
-1.31
□□□□□ -2.62
SNCB
Q16143
RNU4-16P-201
ENST00000364737
141 nt
BASIC
-1.31
□□□□□ -2.62
SNCB
Q16143
RNU6-144P-201
ENST00000383951
107 nt
BASIC
-1.31
□□□□□ -2.62
SNCB
Q16143
SNORA20-201
ENST00000384662
132 nt
BASIC
-1.31
□□□□□ -2.62
SNCB
Q16143
RNU6-332P-201
ENST00000391193
108 nt
BASIC
-1.31
□□□□□ -2.62
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