Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPRKQ15262 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPRKQ15262 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPRKQ15262 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPRKQ15262 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPRKQ15262 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPRKQ15262 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPRKQ15262 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPRKQ15262 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPRKQ15262 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPRKQ15262 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPRKQ15262 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPRKQ15262 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPRKQ15262 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPRKQ15262 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPRKQ15262 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPRKQ15262 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPRKQ15262 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRKQ15262 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRKQ15262 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRKQ15262 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRKQ15262 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRKQ15262 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRKQ15262 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRKQ15262 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRKQ15262 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRKQ15262 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRKQ15262 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRKQ15262 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRKQ15262 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRKQ15262 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRKQ15262 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRKQ15262 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRKQ15262 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRKQ15262 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRKQ15262 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRKQ15262 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRKQ15262 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRKQ15262 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRKQ15262 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRKQ15262 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRKQ15262 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRKQ15262 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRKQ15262 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
PTPRKQ15262 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
PTPRKQ15262 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
PTPRKQ15262 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
PTPRKQ15262 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
PTPRKQ15262 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
PTPRKQ15262 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPRKQ15262 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
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PTPRKQ15262 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPRKQ15262 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPRKQ15262 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
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PTPRKQ15262 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
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PTPRKQ15262 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
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PTPRKQ15262 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPRKQ15262 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
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PTPRKQ15262 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPRKQ15262 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPRKQ15262 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPRKQ15262 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPRKQ15262 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPRKQ15262 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPRKQ15262 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPRKQ15262 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPRKQ15262 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPRKQ15262 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPRKQ15262 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPRKQ15262 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPRKQ15262 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPRKQ15262 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPRKQ15262 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPRKQ15262 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPRKQ15262 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
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