Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ERV3-1Q14264 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
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