Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
ATRQ13535 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
ATRQ13535 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
ATRQ13535 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
ATRQ13535 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
ATRQ13535 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
ATRQ13535 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
ATRQ13535 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
ATRQ13535 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
ATRQ13535 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
ATRQ13535 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
ATRQ13535 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
ATRQ13535 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
ATRQ13535 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
ATRQ13535 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
ATRQ13535 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
ATRQ13535 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ATRQ13535 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ATRQ13535 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ATRQ13535 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ATRQ13535 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ATRQ13535 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ATRQ13535 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC-1.11□□□□□ -2.59
ATRQ13535 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ATRQ13535 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ATRQ13535 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ATRQ13535 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ATRQ13535 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ATRQ13535 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ATRQ13535 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ATRQ13535 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ATRQ13535 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ATRQ13535 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ATRQ13535 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ATRQ13535 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ATRQ13535 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ATRQ13535 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ATRQ13535 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC-1.12□□□□□ -2.59
ATRQ13535 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ATRQ13535 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ATRQ13535 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ATRQ13535 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ATRQ13535 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ATRQ13535 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ATRQ13535 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ATRQ13535 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ATRQ13535 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ATRQ13535 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ATRQ13535 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ATRQ13535 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ATRQ13535 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ATRQ13535 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ATRQ13535 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ATRQ13535 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ATRQ13535 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ATRQ13535 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ATRQ13535 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ATRQ13535 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ATRQ13535 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ATRQ13535 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC-1.13□□□□□ -2.59
ATRQ13535 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ATRQ13535 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ATRQ13535 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ATRQ13535 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ATRQ13535 RNY4P10-201ENST00000365571 96 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ATRQ13535 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ATRQ13535 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ATRQ13535 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ATRQ13535 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ATRQ13535 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC-1.14□□□□□ -2.59
ATRQ13535 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ATRQ13535 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ATRQ13535 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ATRQ13535 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ATRQ13535 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ATRQ13535 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ATRQ13535 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ATRQ13535 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ATRQ13535 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ATRQ13535 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ATRQ13535 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ATRQ13535 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ATRQ13535 SNX3P1Y-201ENST00000615757 176 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ATRQ13535 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ATRQ13535 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ATRQ13535 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ATRQ13535 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ATRQ13535 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ATRQ13535 RNA5SP106-201ENST00000517274 100 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ATRQ13535 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ATRQ13535 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ATRQ13535 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ATRQ13535 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ATRQ13535 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ATRQ13535 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ATRQ13535 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ATRQ13535 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ATRQ13535 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ATRQ13535 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ATRQ13535 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
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