Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TCIRG1Q13488 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TCIRG1Q13488 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TCIRG1Q13488 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
TCIRG1Q13488 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
TCIRG1Q13488 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TCIRG1Q13488 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TCIRG1Q13488 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TCIRG1Q13488 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TCIRG1Q13488 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TCIRG1Q13488 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TCIRG1Q13488 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TCIRG1Q13488 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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TCIRG1Q13488 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TCIRG1Q13488 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TCIRG1Q13488 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TCIRG1Q13488 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TCIRG1Q13488 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TCIRG1Q13488 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
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TCIRG1Q13488 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
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TCIRG1Q13488 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TCIRG1Q13488 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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TCIRG1Q13488 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
TCIRG1Q13488 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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TCIRG1Q13488 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TCIRG1Q13488 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
TCIRG1Q13488 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
TCIRG1Q13488 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
TCIRG1Q13488 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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TCIRG1Q13488 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
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TCIRG1Q13488 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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