Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TCIRG1Q13488 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TCIRG1Q13488 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TCIRG1Q13488 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
TCIRG1Q13488 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
TCIRG1Q13488 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TCIRG1Q13488 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TCIRG1Q13488 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TCIRG1Q13488 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TCIRG1Q13488 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TCIRG1Q13488 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TCIRG1Q13488 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TCIRG1Q13488 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TCIRG1Q13488 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TCIRG1Q13488 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TCIRG1Q13488 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TCIRG1Q13488 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TCIRG1Q13488 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TCIRG1Q13488 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TCIRG1Q13488 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TCIRG1Q13488 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
TCIRG1Q13488 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TCIRG1Q13488 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TCIRG1Q13488 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TCIRG1Q13488 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TCIRG1Q13488 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TCIRG1Q13488 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TCIRG1Q13488 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
TCIRG1Q13488 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
TCIRG1Q13488 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TCIRG1Q13488 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TCIRG1Q13488 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TCIRG1Q13488 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TCIRG1Q13488 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TCIRG1Q13488 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TCIRG1Q13488 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TCIRG1Q13488 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TCIRG1Q13488 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TCIRG1Q13488 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TCIRG1Q13488 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TCIRG1Q13488 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
TCIRG1Q13488 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TCIRG1Q13488 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TCIRG1Q13488 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TCIRG1Q13488 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TCIRG1Q13488 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TCIRG1Q13488 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TCIRG1Q13488 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TCIRG1Q13488 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TCIRG1Q13488 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TCIRG1Q13488 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TCIRG1Q13488 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TCIRG1Q13488 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TCIRG1Q13488 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TCIRG1Q13488 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TCIRG1Q13488 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TCIRG1Q13488 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TCIRG1Q13488 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TCIRG1Q13488 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TCIRG1Q13488 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TCIRG1Q13488 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TCIRG1Q13488 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TCIRG1Q13488 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TCIRG1Q13488 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TCIRG1Q13488 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
TCIRG1Q13488 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TCIRG1Q13488 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
TCIRG1Q13488 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TCIRG1Q13488 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
TCIRG1Q13488 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
TCIRG1Q13488 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
TCIRG1Q13488 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TCIRG1Q13488 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TCIRG1Q13488 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TCIRG1Q13488 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TCIRG1Q13488 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TCIRG1Q13488 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TCIRG1Q13488 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TCIRG1Q13488 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TCIRG1Q13488 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TCIRG1Q13488 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 357.4 ms