Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMAD4Q13485 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMAD4Q13485 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMAD4Q13485 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMAD4Q13485 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMAD4Q13485 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMAD4Q13485 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMAD4Q13485 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMAD4Q13485 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMAD4Q13485 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMAD4Q13485 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMAD4Q13485 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMAD4Q13485 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMAD4Q13485 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMAD4Q13485 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMAD4Q13485 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SMAD4Q13485 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMAD4Q13485 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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