Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
ATMQ13315 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
ATMQ13315 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
ATMQ13315 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
ATMQ13315 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
ATMQ13315 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
ATMQ13315 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
ATMQ13315 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
ATMQ13315 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
ATMQ13315 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
ATMQ13315 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
ATMQ13315 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
ATMQ13315 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
ATMQ13315 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
ATMQ13315 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.75
ATMQ13315 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.75
ATMQ13315 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC-2.16□□□□□ -2.75
ATMQ13315 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.75
ATMQ13315 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.75
ATMQ13315 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC-2.16□□□□□ -2.75
ATMQ13315 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC-2.16□□□□□ -2.75
ATMQ13315 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
ATMQ13315 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
ATMQ13315 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC-2.16□□□□□ -2.76
ATMQ13315 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
ATMQ13315 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
ATMQ13315 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
ATMQ13315 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
ATMQ13315 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC-2.16□□□□□ -2.76
ATMQ13315 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC-2.16□□□□□ -2.76
ATMQ13315 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
ATMQ13315 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
ATMQ13315 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
ATMQ13315 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
ATMQ13315 RNU6-1277P-201ENST00000364561 107 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
ATMQ13315 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
ATMQ13315 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
ATMQ13315 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
ATMQ13315 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
ATMQ13315 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
ATMQ13315 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
ATMQ13315 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
ATMQ13315 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
ATMQ13315 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
ATMQ13315 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
ATMQ13315 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
ATMQ13315 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
ATMQ13315 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
ATMQ13315 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
ATMQ13315 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
ATMQ13315 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
ATMQ13315 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
ATMQ13315 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
ATMQ13315 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
ATMQ13315 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
ATMQ13315 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
ATMQ13315 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
ATMQ13315 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
ATMQ13315 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
ATMQ13315 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
ATMQ13315 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
ATMQ13315 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
ATMQ13315 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
ATMQ13315 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
ATMQ13315 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
ATMQ13315 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
ATMQ13315 MTCO3P42-201ENST00000509488 518 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
ATMQ13315 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
ATMQ13315 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
ATMQ13315 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
ATMQ13315 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
ATMQ13315 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
ATMQ13315 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
ATMQ13315 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
ATMQ13315 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
ATMQ13315 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
ATMQ13315 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
ATMQ13315 RNY4P13-201ENST00000384284 96 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
ATMQ13315 RNU6-665P-201ENST00000384639 107 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
ATMQ13315 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
ATMQ13315 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
ATMQ13315 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
ATMQ13315 AC114982.2-201ENST00000461396 358 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
ATMQ13315 RNU6-345P-201ENST00000517001 107 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
ATMQ13315 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
ATMQ13315 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
ATMQ13315 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
ATMQ13315 RNU6-737P-201ENST00000365370 107 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
ATMQ13315 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
ATMQ13315 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
ATMQ13315 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
ATMQ13315 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
ATMQ13315 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
ATMQ13315 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
ATMQ13315 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
ATMQ13315 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
ATMQ13315 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
ATMQ13315 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
ATMQ13315 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
ATMQ13315 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC-2.21□□□□□ -2.76
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