Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
TRDNQ13061 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
TRDNQ13061 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
TRDNQ13061 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
TRDNQ13061 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
TRDNQ13061 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
TRDNQ13061 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
TRDNQ13061 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
TRDNQ13061 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
TRDNQ13061 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.25□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
TRDNQ13061 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TRDNQ13061 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TRDNQ13061 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TRDNQ13061 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TRDNQ13061 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TRDNQ13061 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TRDNQ13061 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TRDNQ13061 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC-0.29□□□□□ -2.46
TRDNQ13061 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TRDNQ13061 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TRDNQ13061 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TRDNQ13061 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TRDNQ13061 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 184 ms