Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
BNIP3Q12983 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
BNIP3Q12983 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
BNIP3Q12983 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
BNIP3Q12983 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
BNIP3Q12983 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
BNIP3Q12983 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
BNIP3Q12983 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
BNIP3Q12983 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
BNIP3Q12983 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
BNIP3Q12983 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
BNIP3Q12983 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
BNIP3Q12983 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
BNIP3Q12983 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
BNIP3Q12983 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
BNIP3Q12983 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
BNIP3Q12983 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
BNIP3Q12983 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
BNIP3Q12983 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
BNIP3Q12983 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
BNIP3Q12983 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
BNIP3Q12983 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
BNIP3Q12983 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
BNIP3Q12983 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
BNIP3Q12983 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
BNIP3Q12983 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
BNIP3Q12983 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
BNIP3Q12983 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
BNIP3Q12983 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
BNIP3Q12983 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
BNIP3Q12983 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
BNIP3Q12983 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
BNIP3Q12983 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
BNIP3Q12983 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
BNIP3Q12983 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
BNIP3Q12983 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
BNIP3Q12983 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
BNIP3Q12983 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
BNIP3Q12983 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
BNIP3Q12983 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
BNIP3Q12983 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
BNIP3Q12983 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
BNIP3Q12983 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
BNIP3Q12983 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
BNIP3Q12983 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
BNIP3Q12983 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
BNIP3Q12983 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
BNIP3Q12983 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
BNIP3Q12983 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
BNIP3Q12983 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
BNIP3Q12983 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
BNIP3Q12983 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
BNIP3Q12983 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
BNIP3Q12983 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
BNIP3Q12983 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
BNIP3Q12983 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
BNIP3Q12983 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
BNIP3Q12983 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
BNIP3Q12983 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
BNIP3Q12983 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
BNIP3Q12983 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
BNIP3Q12983 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
BNIP3Q12983 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
BNIP3Q12983 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
BNIP3Q12983 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
BNIP3Q12983 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
BNIP3Q12983 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
BNIP3Q12983 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
BNIP3Q12983 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
BNIP3Q12983 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
BNIP3Q12983 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
BNIP3Q12983 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
BNIP3Q12983 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
BNIP3Q12983 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
BNIP3Q12983 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
BNIP3Q12983 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
BNIP3Q12983 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
BNIP3Q12983 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
BNIP3Q12983 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
BNIP3Q12983 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
BNIP3Q12983 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
BNIP3Q12983 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
BNIP3Q12983 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
BNIP3Q12983 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
BNIP3Q12983 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BNIP3Q12983 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BNIP3Q12983 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BNIP3Q12983 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BNIP3Q12983 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BNIP3Q12983 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BNIP3Q12983 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BNIP3Q12983 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BNIP3Q12983 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BNIP3Q12983 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BNIP3Q12983 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BNIP3Q12983 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BNIP3Q12983 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BNIP3Q12983 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
BNIP3Q12983 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
BNIP3Q12983 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 257.1 ms