Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC-0.04□□□□□ -2.42
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FOXF1Q12946 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
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FOXF1Q12946 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
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FOXF1Q12946 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
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FOXF1Q12946 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.08□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
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