Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
LMAN2Q12907 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
LMAN2Q12907 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
LMAN2Q12907 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
LMAN2Q12907 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
LMAN2Q12907 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
LMAN2Q12907 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
LMAN2Q12907 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
LMAN2Q12907 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
LMAN2Q12907 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
LMAN2Q12907 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
LMAN2Q12907 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
LMAN2Q12907 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
LMAN2Q12907 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
LMAN2Q12907 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
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