Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CLDN9O95484 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC0.02□□□□□ -2.41
CLDN9O95484 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CLDN9O95484 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
CLDN9O95484 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CLDN9O95484 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
CLDN9O95484 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CLDN9O95484 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CLDN9O95484 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CLDN9O95484 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CLDN9O95484 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CLDN9O95484 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CLDN9O95484 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CLDN9O95484 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CLDN9O95484 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CLDN9O95484 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CLDN9O95484 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CLDN9O95484 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CLDN9O95484 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CLDN9O95484 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CLDN9O95484 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CLDN9O95484 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CLDN9O95484 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0□□□□□ -2.41
CLDN9O95484 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CLDN9O95484 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CLDN9O95484 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CLDN9O95484 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CLDN9O95484 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CLDN9O95484 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CLDN9O95484 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CLDN9O95484 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CLDN9O95484 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CLDN9O95484 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CLDN9O95484 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CLDN9O95484 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CLDN9O95484 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CLDN9O95484 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CLDN9O95484 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CLDN9O95484 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CLDN9O95484 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CLDN9O95484 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CLDN9O95484 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CLDN9O95484 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CLDN9O95484 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CLDN9O95484 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CLDN9O95484 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CLDN9O95484 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CLDN9O95484 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CLDN9O95484 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
CLDN9O95484 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CLDN9O95484 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CLDN9O95484 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CLDN9O95484 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CLDN9O95484 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CLDN9O95484 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CLDN9O95484 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CLDN9O95484 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CLDN9O95484 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CLDN9O95484 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CLDN9O95484 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CLDN9O95484 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CLDN9O95484 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CLDN9O95484 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
CLDN9O95484 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CLDN9O95484 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CLDN9O95484 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CLDN9O95484 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CLDN9O95484 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CLDN9O95484 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CLDN9O95484 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CLDN9O95484 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CLDN9O95484 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CLDN9O95484 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CLDN9O95484 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CLDN9O95484 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CLDN9O95484 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CLDN9O95484 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CLDN9O95484 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CLDN9O95484 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CLDN9O95484 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CLDN9O95484 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CLDN9O95484 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CLDN9O95484 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CLDN9O95484 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CLDN9O95484 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CLDN9O95484 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CLDN9O95484 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CLDN9O95484 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CLDN9O95484 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CLDN9O95484 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CLDN9O95484 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CLDN9O95484 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CLDN9O95484 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CLDN9O95484 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CLDN9O95484 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CLDN9O95484 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CLDN9O95484 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CLDN9O95484 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CLDN9O95484 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CLDN9O95484 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.2 ms