Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.19□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC0.16□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
UBXN8O00124 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
UBXN8O00124 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
UBXN8O00124 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
UBXN8O00124 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
UBXN8O00124 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
UBXN8O00124 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
UBXN8O00124 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
UBXN8O00124 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
UBXN8O00124 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
UBXN8O00124 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
UBXN8O00124 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
UBXN8O00124 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
UBXN8O00124 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
UBXN8O00124 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
UBXN8O00124 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
UBXN8O00124 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
UBXN8O00124 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
UBXN8O00124 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
UBXN8O00124 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
UBXN8O00124 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
UBXN8O00124 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
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