Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ERVV-2B6SEH9 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
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