Protein–RNA interactions for Protein: A0PK11

CLRN2, Clarin-2, humanhuman

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN2A0PK11 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.06□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CLRN2A0PK11 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
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