Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC-1.82□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
TRBV7-4A0A0J9YYF1 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-1.87□□□□□ -2.71
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC-1.89□□□□□ -2.71
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC-1.9□□□□□ -2.71
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.4 ms