Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
USP18Q9UMW8 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
USP18Q9UMW8 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
USP18Q9UMW8 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
USP18Q9UMW8 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
USP18Q9UMW8 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
USP18Q9UMW8 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
USP18Q9UMW8 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
USP18Q9UMW8 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
USP18Q9UMW8 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
USP18Q9UMW8 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
USP18Q9UMW8 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
USP18Q9UMW8 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
USP18Q9UMW8 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
USP18Q9UMW8 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
USP18Q9UMW8 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
USP18Q9UMW8 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
USP18Q9UMW8 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
USP18Q9UMW8 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
USP18Q9UMW8 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
USP18Q9UMW8 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
USP18Q9UMW8 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
USP18Q9UMW8 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
USP18Q9UMW8 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
USP18Q9UMW8 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
USP18Q9UMW8 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
USP18Q9UMW8 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
USP18Q9UMW8 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
USP18Q9UMW8 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
USP18Q9UMW8 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
USP18Q9UMW8 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
USP18Q9UMW8 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
USP18Q9UMW8 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
USP18Q9UMW8 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
USP18Q9UMW8 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
USP18Q9UMW8 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
USP18Q9UMW8 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
USP18Q9UMW8 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
USP18Q9UMW8 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USP18Q9UMW8 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USP18Q9UMW8 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USP18Q9UMW8 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USP18Q9UMW8 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USP18Q9UMW8 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USP18Q9UMW8 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USP18Q9UMW8 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USP18Q9UMW8 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USP18Q9UMW8 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
USP18Q9UMW8 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USP18Q9UMW8 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USP18Q9UMW8 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USP18Q9UMW8 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USP18Q9UMW8 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USP18Q9UMW8 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USP18Q9UMW8 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USP18Q9UMW8 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USP18Q9UMW8 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USP18Q9UMW8 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
USP18Q9UMW8 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
USP18Q9UMW8 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
USP18Q9UMW8 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
USP18Q9UMW8 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
USP18Q9UMW8 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
USP18Q9UMW8 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
USP18Q9UMW8 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
USP18Q9UMW8 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
USP18Q9UMW8 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
USP18Q9UMW8 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
USP18Q9UMW8 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
USP18Q9UMW8 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
USP18Q9UMW8 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
USP18Q9UMW8 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
USP18Q9UMW8 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
USP18Q9UMW8 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
USP18Q9UMW8 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
USP18Q9UMW8 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
USP18Q9UMW8 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
USP18Q9UMW8 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
USP18Q9UMW8 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
USP18Q9UMW8 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
USP18Q9UMW8 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
USP18Q9UMW8 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
USP18Q9UMW8 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
USP18Q9UMW8 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
USP18Q9UMW8 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
USP18Q9UMW8 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
USP18Q9UMW8 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
USP18Q9UMW8 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
USP18Q9UMW8 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
USP18Q9UMW8 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
USP18Q9UMW8 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
USP18Q9UMW8 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
USP18Q9UMW8 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
USP18Q9UMW8 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
USP18Q9UMW8 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
USP18Q9UMW8 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
USP18Q9UMW8 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
USP18Q9UMW8 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
USP18Q9UMW8 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
USP18Q9UMW8 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 194.1 ms