Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
EHD3Q9NZN3 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
EHD3Q9NZN3 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
EHD3Q9NZN3 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
EHD3Q9NZN3 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
EHD3Q9NZN3 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
EHD3Q9NZN3 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
EHD3Q9NZN3 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
EHD3Q9NZN3 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
EHD3Q9NZN3 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
EHD3Q9NZN3 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
EHD3Q9NZN3 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
EHD3Q9NZN3 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
EHD3Q9NZN3 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
EHD3Q9NZN3 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
EHD3Q9NZN3 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
EHD3Q9NZN3 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
EHD3Q9NZN3 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
EHD3Q9NZN3 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
EHD3Q9NZN3 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
EHD3Q9NZN3 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
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