Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.51□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.5□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CHCHD3Q9NX63 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC0.46□□□□□ -2.34
CHCHD3Q9NX63 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CHCHD3Q9NX63 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CHCHD3Q9NX63 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CHCHD3Q9NX63 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CHCHD3Q9NX63 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CHCHD3Q9NX63 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CHCHD3Q9NX63 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CHCHD3Q9NX63 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CHCHD3Q9NX63 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CHCHD3Q9NX63 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
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