Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

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Length 1,200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TRERF1Q96PN7 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRERF1Q96PN7 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRERF1Q96PN7 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
TRERF1Q96PN7 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TRERF1Q96PN7 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TRERF1Q96PN7 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TRERF1Q96PN7 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TRERF1Q96PN7 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TRERF1Q96PN7 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TRERF1Q96PN7 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
TRERF1Q96PN7 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRERF1Q96PN7 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRERF1Q96PN7 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRERF1Q96PN7 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRERF1Q96PN7 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRERF1Q96PN7 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRERF1Q96PN7 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRERF1Q96PN7 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRERF1Q96PN7 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRERF1Q96PN7 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TRERF1Q96PN7 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRERF1Q96PN7 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRERF1Q96PN7 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRERF1Q96PN7 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRERF1Q96PN7 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRERF1Q96PN7 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRERF1Q96PN7 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRERF1Q96PN7 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
TRERF1Q96PN7 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRERF1Q96PN7 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRERF1Q96PN7 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRERF1Q96PN7 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRERF1Q96PN7 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRERF1Q96PN7 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRERF1Q96PN7 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRERF1Q96PN7 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRERF1Q96PN7 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRERF1Q96PN7 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
TRERF1Q96PN7 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRERF1Q96PN7 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRERF1Q96PN7 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRERF1Q96PN7 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRERF1Q96PN7 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRERF1Q96PN7 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRERF1Q96PN7 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRERF1Q96PN7 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRERF1Q96PN7 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRERF1Q96PN7 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRERF1Q96PN7 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRERF1Q96PN7 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
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