Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PRAC1Q96KF2 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PRAC1Q96KF2 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PRAC1Q96KF2 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PRAC1Q96KF2 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PRAC1Q96KF2 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PRAC1Q96KF2 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PRAC1Q96KF2 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PRAC1Q96KF2 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PRAC1Q96KF2 RPL12P49-201ENST00000441100 121 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PRAC1Q96KF2 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PRAC1Q96KF2 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PRAC1Q96KF2 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PRAC1Q96KF2 IGLVI-70-201ENST00000523272 390 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PRAC1Q96KF2 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
PRAC1Q96KF2 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PRAC1Q96KF2 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PRAC1Q96KF2 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PRAC1Q96KF2 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PRAC1Q96KF2 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.71□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 MIR431-201ENST00000385266 114 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC0.71□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.7□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 RNA5SP427-201ENST00000365323 119 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.7□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 MIR4327-201ENST00000581194 85 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.7□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.68□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PRAC1Q96KF2 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 223.6 ms